El 4 de mayo de 1985, un grupo de jóvenes del Movimiento Apostólico de Schoenstatt en Paraguay tomó la iniciativa de ayudar a los niños que trabajaban en una zona del país, conocida como Calle Última, en la ciudad de Fernando de la Mora. Organizaron jornadas de catecismo y merienda, los sábados a la tarde en la Capilla Medalla Milagrosa. A la primera invitación llegaron 33 pequeños vendedores ambulantes de golosinas y diarios. El espíritu joven y solidario de los jóvenes, movido por el amor de María, inició en forma sencilla una obra de servicio hacia los más humildes.
Actualmente, DEQUENI cuenta con una serie de programas tales como: Protección de niños y adolescentes en riesgo; Programa de atención a la Primera Infancia; Programa de desarrollo comunitario; Programa de capacitación y entrenamiento laboral.